Comparative epigenomics across the barley pangenome links structural variation to regulatory genome function
20種類のオオムギ遺伝子型にわたるマルチオミクスデータの統合により、本研究は、構造変異がエピゲノムを全般的に再構築するわけではない一方で、局所的なクロマチン相互作用の文脈依存的な再編を通じて、調節の多様性と生育型の差異を駆動していることを明らかにしている。
296 件の論文
植物生物学は、花が咲く仕組みから根が土から栄養を吸い上げる過程まで、植物の命を支えるあらゆるメカニズムを探求する分野です。Gist.Scienceでは、この分野で最先端の研究を迅速に届けます。
当サイトでは、bioRxiv に投稿された全ての新しいプレプリントを網羅的に処理しています。専門用語で書かれた複雑な論文を、誰もが理解できる平易な解説と、詳細な技術的サマリーの両面で提供し、科学の最先端を身近に感じられるよう努めています。
以下に、植物生物学に関する最新のプレプリント論文リストを掲載します。
20種類のオオムギ遺伝子型にわたるマルチオミクスデータの統合により、本研究は、構造変異がエピゲノムを全般的に再構築するわけではない一方で、局所的なクロマチン相互作用の文脈依存的な再編を通じて、調節の多様性と生育型の差異を駆動していることを明らかにしている。
本研究は、ArabidopsisのPWO1とTRBタンパク質間の進化的に保存された相互作用が、二次細胞壁形成に関与する遺伝子の発現を共同で制御することにより、クロマチン調節を調整し、早すぎる分化および異所的なリグニン沈着を抑制することを明らかにしている。
近接ラベル化法と機能解析を用いた本研究は、ジェミニウイルスがDNAポリメラーゼδを含む特定の宿主DNA複製因子を選択的に再利用して、リーディング鎖様モードによるローリングサークル型ゲノム複製を支えるウイルスレプリソームを形成することを明らかにしている。
本研究は、受容体キナーゼNILR1が、典型的な病原体誘発免疫シグナル伝達経路を介するのではなく、主にHAT7/GTL1を中心としたブラシノステロイド駆動型の皮層発達モジュールを調節することによって、*Heterodera schachtii*(テンサイネコブセンチュウ)に対する量的抵抗性を付与することを実証している。
本研究は、4倍体ジャガイオにおけるBEL5遺伝子の完全なノックアウトを達成するために、繰り返しのデノボ再生を伴う最適化されたCRISPR-Cas9手法を確立し、BEL5が塊茎形成開始のタイミングを調節する一方で、全体の塊茎収量には必須ではないことを明らかにした。
本論文は、凍結されたDINOv3埋め込みと条件付き正規化フローを活用することで、圃場画像から5つの主要なバナナ病害をほぼ完璧な精度で検出すると同時に、小規模農家システムへのスケーラブルな展開に向けた解釈可能な不確実性推定を提供する、軽量で確率的な画像認識フレームワークを提示する。
本研究は、ゼニゴケの葉緑体を迅速に単離するための最適化されたプロトコルを導入することで、そのプロテオームを特性評価し、クロロリボソーム大サブユニットおよびRuBisCOの高分解能クライオ電子顕微鏡構造を決定し、祖先的なゲノム縮小にもかかわらず、コケ植物のプラスチドが被子植物に匹敵する高いレベルの構造的保存性と複雑性を維持していることを明らかにしている。
本研究は、シロイヌナズナにおける37°Cから40°Cの熱勾配にわたる高解像度RNA-seqプロファイリングを利用することで、この狭い範囲内における熱ショック応答の温度特異的な微調整が、獲得された耐熱性の成功的な獲得を決定づけていることを明らかにしている。
本研究は、多様なジアザトロフ(窒素固定菌)、特に*Marinobacter lutimaris*から特定のNifUおよびNifSホモログを選択することが、[Fe-S]クラスター構築のための生化学的要件と、宿主の葉緑体における生理学的混乱およびプロテオームの変化を最小限に抑える必要性とのバランスをとる上で、植物へのニトロゲナーゼ導入エンジニアリングにおいて極めて重要であることを示している。
本研究は、特定の遺伝子座によって制御される保存された増殖転写状態という、受け継がれた遺伝プログラムが、環境適応の影響を上回り、種間における全植物トランスクリプトーム変異の主要な組織化因子であることを明らかにしている。